「秋行軍蟲災害緊急應變小組」（簡稱應變小組）表示，佈設在金門縣20點性費洛蒙誘集器（108年6月間佈設）7月間截獲到較多秋行軍蟲成蟲後，金門縣政府於7月30日發現高粱秋行軍蟲首例疫情並通報農委會防檢局，該局因應緊急防治需要，旋即公告10種高粱秋行軍蟲緊急防治藥劑。因為疫情發生面積廣大，防檢局除8月1日也派員赴金門現地勘察發生情形外，今(5)日4所大學植物醫師團隊也進駐金門調查，目前調查金門縣約600多公頃通報確認案例，針對發生危害田區，金門縣政府正依第二階段緊急防治標準作業程序進行強制施藥，已完成146.84公頃防治作業，疫情均在監控當中。
應變小組進一步說明，金門縣高粱栽培面積約2,000公頃，是金門最主要經濟作物，目前正值高粱種植季且為秋行軍蟲危害適期，為協助縣府強化防疫量能，今日防檢局委託由臺灣大學、中興大學、嘉義大學及屏東科技大學四所大學植物醫師團隊進駐金門，協助指導秋行軍蟲為害特徵鑑識、緊急防治用藥施用及調查其他寄主作物發生狀況，以利疫情掌控並減少作物損失。
目前國內仍在秋行軍蟲緊急防治第二階段，持續目視巡查仍為發現秋行軍蟲最主要方法，可藉此掌握發生情形並即時防治，加以管控。秋作之小麥、高粱、毛豆、落花生及甘藷為高風險寄主作物，田間巡檢作業仍需即早進行，不可輕忽疫情。秋行軍蟲相關疫情資訊，每日更新於「秋行軍蟲專區」（網址:http://faw.baphiq.gov.tw/），歡迎上網參考。